1、难以筹集大量资金。因为一个人的资金终归有限，以个人名义借贷款难度也较大。因此，独资企业限制了企业的扩展和大规模经营。

2、投资者风险巨大。企业业主对企业负无限责任，在硬化了企业预算约束的同时，也带来了业主承担风险过大的问题，从而限制了业主向风险较大的部门或领域进行投资的活动。这对新兴产业的形成和发展极为不利。

3、企业连续性差。企业所有权和经营权高度统一的产权结构，虽然使企业拥有充分的自主权，但这也意味着企业是自然人的企业，业主的病、死，他个人及家属知识和能力的缺乏，都可能导致企业破产。

4、企业内部的基本关系是雇佣劳动关系，劳资双方利益目标的差异，构成企业内部组织效率的潜在危险。

1、个人独资企业必须要有固定的生产经营场所和合法的企业名称，而个体工商户可以不起字号名称，也可以没有固定的生产经营场所而流动经营。换句话说，合法的企业名称和固定的生产经营场所是个人独资企业的成立要件，但不是个体工商户的成立要件。

 

2、个体工商户的投资者与经营者是同一人，都必须是投资设立个体工商户的自然人。而个人独资企业的投资者与经营者可以是不同的人，投资人可以委托或聘用他人管理个人独资企业事务。也就是说，个人独资企业的所有权与经营权是可以分离的，这就决定了个人独资企业更符合现代企业制度的特征。而个体工商户的所有权与经营权是集于投资者一身的，已不能适应于现代企业制度发展的要求，所以它只能适用于小规模的经营主体。

 

3、个人独资企业可以设立分支机构，也可以委派他人作为个人独资企业分支机构负责人。这一规定，说明了个人独资企业不但可以在登记管理机关辖区内设立分支机构，也可以在异地设立分支机构，由设立该分支机构的个人独资企业承担责任。而个体工商户根据规定不能设立分支机构。另一方面个体工商户虽然可以异地经营，但随着各地近几年相继简化了外来人员的登记手续，从而使个体工商户的异地经营这一规定逐渐淡化。由此可以看出，个人独资企业的总体规模一般大于个体工商户。

 

4、个人独资企业与个体工商户的法律地位不尽相同。在民事、行政、经济法律制度中个人独资企业是其他组织或其它经济组织的一种形式，能以企业自身的名义进行法律活动。而个体工商户是否能够作为其它组织或其它经济组织的一种形式，一直是国内民法学家的争论对象。在日常法律活动中，个体工商户的法律行为能力往往受到一定的限制，更多的时候，个体工商户是以公民个人名义进行法律活动的。事实上，国内就有许多法律专家提出个体工商户不是法律意义上的企业。另外，个人独资企业与个体工商户作为市场主体参与市场经济其他活动的能力不同，如个人独资企业可以成为公司的股东，从而以企业名义享有公司股东的权利和义务，而个体工商户一般不能以企业名义作为公司股东，只能以个人投资者(自然人)身份成为公司股东。

 

5、个人独资企业与个体工商户在财务制度和税收政策上的要求也不尽相同。事实上，这也是投资者较关心的问题。根据《个人独资企业法》的规定,个人独资企业必须建立财务制度，以进行会计核算。值得一提的是，个人独资企业的财务制度是个人独资企业的必备条件，不以任何部门的要求而改变。而个体工商户由于情况复杂，是否要建立会计制度争论较多，在即将实施的新《会计法》中也只作了原则规定。按照执法情况看，个体工商户可以按照税务机关的要求建立账簿，如税务部门不作要求的，也可以不进行会计核算。另外，在税收政策方面，由于我国的税收法律制度是一个相对独立的体系，它与市场主体法律制度之间没有统一的联系。税务部门认定一般纳税人和小规模纳税人的标准并不是以企业的市场主体地位不同而划分的。一般来说，个体工商户较难认定为一般纳税人，而个人独资企业如符合条件则可以认定为一般纳税人。如何把市场主体立法与税收立法有机地结合起来，是今后完善社会主义市场经济法律制度值得探讨的问题。

 

企业所得税    个人所得税（分红）   合计税金
有限公司    1000x25%=250  750x20%=150          400
设立个人独资企业抵相应的企业成本：1000万利润成本，服务费、咨询费、劳务外包服务费等现代服务业作为个人经营劳动所得
增值税                  个人所得税          合计税金
1000x6%=60万（可抵扣）  1000x3.5%=35万         95万
（实际只缴纳了35万）
在同样完成税收清缴情况下两者相比，相差305万元，除去增值税抵扣的话相差365万。
 
 
2、如何通过个人独资企业转移企业利润

A生产型公司（外省市企业）、B公司（注册在山阳园区）C客户企业
原流程：
进项发票3000万——》A公司8000万——》C客户
所缴纳税额：增值税：（8000-3000）*13%=650万
             企业所得税：5000*30%（企业利润）*25%=375万
             个人所得税（分红）1125*20%=225万
             合计税收:1250万
通过个人独资转移企业利润后：
进项发票3000万——》个人独资企业8000万——》A公司8100——》C客户
个人独资所缴纳税额：增值税：（8000-3000）*13%=650万
                    个人所得税（核定征收）8000*1.75%=140万
A公司缴纳：增值税： （8100-8000）*13%=13万
           企业所得税：100*30%（企业利润）*25%=7.5万
个人所得税（分红）92.5*20%=18.5万
合计金额：个人独资企业790+A公司39=829.
两者比较：1250-829=421万
 
 
3、通过个人独资转移企业利润后：

进项发票3000万——》个人独资企业8000万——》B公司8050万——》A公司8100——》C客户
 
个人独资所缴纳税额：增值税：（8000-3000）*13%=650万
                    个人所得税（核定征收）8000*1.75%=140万
B公司缴纳：增值税：（8050-8000）*13%=6.5万
           企业所得税：50*30%（企业利润）*25%=3.75万
           个人所得税（分红）：13.75*20%=2.75
A公司缴纳：增值税： （8100-8050）*13%=6.5万
           企业所得税：50*30%（企业利润）*25%=3.75万
个人所得税（分红）13.75*20%=2.75万
合计：个人独资790+B公司13+A公司13=816万。两者比较：1250-816=434万